Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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VPS72Q15906 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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