Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SHBQ15464 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms