Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
R3HDM1Q15032 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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