Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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