Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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