Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms