Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms