Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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SHROOM2Q13796 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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SHROOM2Q13796 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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SHROOM2Q13796 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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SHROOM2Q13796 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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SHROOM2Q13796 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHROOM2Q13796 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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SHROOM2Q13796 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
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SHROOM2Q13796 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
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