Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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