Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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