Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms