Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.478e-7■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.478e-7■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.538e-7■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.588e-7■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.312e-8■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.172e-8■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 JPT1-201ENST00000304834 1633 ntTSL 1 (best)19.94■□□□□ 0.782e-8■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.732e-8■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.122e-8■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-8■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 JPT1-208ENST00000481647 576 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-8■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 RPS27L-206ENST00000482846 2944 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.246e-8■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.046e-8■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.056e-8■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.486e-8■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 MRPL52-212ENST00000556214 579 ntTSL 221.94■■□□□ 1.18e-10■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 MRPL52-207ENST00000553482 595 ntTSL 321.74■■□□□ 1.078e-10■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 MRPL52-217ENST00000557543 2020 ntTSL 220.61■□□□□ 0.898e-10■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.092e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 BIRC5-208ENST00000590925 648 ntTSL 1 (best)22.01■■□□□ 1.112e-9■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.632e-12■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.32e-12■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 DHCR7-212ENST00000534795 979 ntTSL 1 (best)15.95■□□□□ 0.142e-12■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.393e-10■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.393e-10■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.993e-10■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.473e-10■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 B4GALT3-207ENST00000470882 3178 ntTSL 512.48□□□□□ -0.412e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.043e-13■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.13e-13■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 TMOD1-203ENST00000395211 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.753e-13■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 KHSRP-205ENST00000595223 956 ntTSL 521.46■■□□□ 1.031e-7■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 RNF138-201ENST00000257190 2071 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.783e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 RPL13A-208ENST00000477613 796 ntTSL 521.08■□□□□ 0.974e-23■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 RPL13A-202ENST00000467825 660 ntTSL 518.15■□□□□ 0.54e-23■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.535e-11■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.414e-7■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 CFL1-209ENST00000530413 647 ntTSL 1 (best)18.69■□□□□ 0.585e-11■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 HOXB2-202ENST00000504772 930 ntTSL 317.47■□□□□ 0.394e-7■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 SDHC-206ENST00000470743 832 ntTSL 511.59□□□□□ -0.555e-11■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 VRK1-206ENST00000557222 1029 ntTSL 510.68□□□□□ -0.75e-11■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.164e-7■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 UTP6-202ENST00000477128 2344 ntTSL 27.73□□□□□ -1.174e-7■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 VRK1-205ENST00000555402 415 ntTSL 37.54□□□□□ -1.25e-11■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 VRK1-203ENST00000555067 604 ntTSL 37.34□□□□□ -1.235e-11■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 UTP6-204ENST00000484661 694 ntTSL 26.4□□□□□ -1.384e-7■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 UTP6-206ENST00000579459 410 ntTSL 36.13□□□□□ -1.434e-7■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 UTP6-208ENST00000581012 563 ntTSL 55.63□□□□□ -1.514e-7■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 EIF3E-208ENST00000519517 726 ntTSL 35.55□□□□□ -1.524e-9■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.525e-11■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 MYL12A-204ENST00000578038 463 ntTSL 35.23□□□□□ -1.571e-33■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.274e-19■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.234e-19■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.352e-31■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 UBAC1-206ENST00000489050 864 ntTSL 311.93□□□□□ -0.52e-31■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 NACA-212ENST00000549259 690 ntTSL 512.63□□□□□ -0.399e-23■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 NACA-220ENST00000552055 521 ntTSL 510.65□□□□□ -0.79e-23■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 NDUFS3-202ENST00000524568 733 ntTSL 223.6■■□□□ 1.372e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.134e-32■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 MICU1-212ENST00000642044 2221 ntBASIC13.6□□□□□ -0.234e-32■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 MICU1-211ENST00000635239 2215 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.254e-32■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 MICU1-201ENST00000361114 2383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.384e-32■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 MICU1-205ENST00000476605 1933 ntTSL 211.31□□□□□ -0.64e-32■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.384e-7■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.214e-7■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 BRD2-209ENST00000469132 1628 ntTSL 221.49■■□□□ 1.037e-25■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.497e-25■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.267e-25■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 BRD2-212ENST00000482914 4834 ntTSL 1 (best)15.36■□□□□ 0.057e-25■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 BRD2-204ENST00000449025 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.277e-25■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 BRD2-205ENST00000449085 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.277e-25■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 BRD2-203ENST00000395287 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.757e-25■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.475e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.255e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.255e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.222e-8■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.873e-7■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.672e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 DHCR7-203ENST00000525137 996 ntTSL 318.42■□□□□ 0.544e-14■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 SOD1-204ENST00000476106 586 ntTSL 516.18■□□□□ 0.186e-8■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.072e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.772e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 TMC6-222ENST00000592076 693 ntTSL 319.55■□□□□ 0.722e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.682e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.342e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.823e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.643e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.643e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.483e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.453e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.393e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.093e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.683e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.52e-11■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 RPS2-204ENST00000526908 638 ntTSL 224.8■■□□□ 1.562e-47■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.964e-10■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 HMGN1-206ENST00000431390 1552 ntTSL 320.76■□□□□ 0.914e-10■□□□□ 10.7
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