Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXF1Q12946 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXF1Q12946 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXF1Q12946 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXF1Q12946 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXF1Q12946 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXF1Q12946 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXF1Q12946 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXF1Q12946 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXF1Q12946 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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FOXF1Q12946 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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FOXF1Q12946 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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FOXF1Q12946 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXF1Q12946 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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