Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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