Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CDH17Q12864 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CDH17Q12864 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH17Q12864 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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