Protein–RNA interactions for Protein: Q12765

SCRN1, Secernin-1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN1Q12765 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRN1Q12765 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms