Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms