Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms