Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms