Protein–RNA interactions for Protein: Q05823

RNASEL, 2-5A-dependent ribonuclease, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASELQ05823 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNASELQ05823 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms