Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RELAQ04206 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RELAQ04206 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms