Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.9 ms