Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms