Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms