Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
COPAP53621 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COPAP53621 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COPAP53621 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COPAP53621 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPAP53621 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPAP53621 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms