Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERFP50548 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERFP50548 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms