Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSK3BP49841 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GSK3BP49841 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSK3BP49841 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSK3BP49841 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GSK3BP49841 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSK3BP49841 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GSK3BP49841 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSK3BP49841 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSK3BP49841 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSK3BP49841 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSK3BP49841 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GSK3BP49841 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.2 ms