Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA3P35244 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA3P35244 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA3P35244 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA3P35244 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA3P35244 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPA3P35244 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPA3P35244 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms