Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPC1P35052 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPC1P35052 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms