Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms