Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA6P31267 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms