Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA10P31260 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA10P31260 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms