Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1P21675 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1P21675 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1P21675 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1P21675 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1P21675 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1P21675 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1P21675 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1P21675 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1P21675 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1P21675 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1P21675 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1P21675 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1P21675 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1P21675 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1P21675 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1P21675 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1P21675 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1P21675 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1P21675 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1P21675 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1P21675 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1P21675 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1P21675 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1P21675 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1P21675 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1P21675 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1P21675 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1P21675 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms