Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms