Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CREB1P16220 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CREB1P16220 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB1P16220 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB1P16220 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms