Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HKR1P10072 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HKR1P10072 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176 ms