Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GIMD1P0DJR0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms