Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms