Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9P02748 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9P02748 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9P02748 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9P02748 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9P02748 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9P02748 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9P02748 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9P02748 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9P02748 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
C9P02748 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9P02748 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9P02748 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms