Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPP2O95045 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP2O95045 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP2O95045 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms