Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSVO60911 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms