Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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