Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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