Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms