Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP20Q9Y2K6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms