Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC4Q9Y296 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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