Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RAB23Q9ULC3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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