Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC88CQ9P219 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms