Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms