Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms